本系講座教授共 10 員(含 2 位中研院院士;1 位比利時院士),專任教授 25 位,其中有 7 位教授獲得國科會吳大猷紀念獎,2 位教授獲得科技部愛因斯坦計畫,1 位教授獲得科技部哥倫布計畫,2位教授獲得教育部玉山青年學者,已成為陣容完整的學術研究團隊,領域涵蓋高分子與材料化學、生物分析、生醫光電科技、再生能源、超快動力研究、超高解析度光譜及理論計算化學、高等有機化學等,提供研究生充沛的研究資源。
在新一期教育部高教深耕計畫,「新世代功能性物質研究中心」以應化系為主並跨接其他院系,是全國少數獲教育部核准的特色領域研究中心並獲科技部專案重點補助的特色中心,貢獻於新世代綠能材料及柔性元件開發,新世代智慧生醫檢測及柔性電子技術開發等領域,幫助政府發展「綠能科技」與「生技產業」等創新產業。應化系每年的研究經費約為 1.5 億元。
在教學上,教師的教學實踐也受到學生肯定,多位老師得到陽明交大理學院優良教師與優良教學獎的肯定。在科學研究與產學應用上,應化系的研究團隊在 SCI 研究論文發表數穩定成長,無論就篇數與成長率均居陽明交大理學院之冠,與國內研究型大學的化學系並駕齊驅。